為了落實校際間的交流，每年皆會舉辦藥學年會，七校每年輪流籌備舉辦。年會是一個很好的管道讓藥學生了解最新的外界資訊，而不是只侷限在自己的學校，被拒絕於社會趨勢潮流之外。同時也可以讓籌辦的學校，介紹各校藥學生的優良傳統、學術成果及蓬勃的學生活動。藉由講座課程及相關論壇，促進校與校間的藥學生相互認識，以增進台灣藥學生情感交流，並拓展藥學生在學術及國際上的視野，由此期望藥學生團結及互助，促進藥學成就之進步。
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年會包含:
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年會流程:
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第15屆全國藥學生年會新聞稿
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藥學生年會歷年舉辦地點與臉書粉專
19th 藥學生年會 於 中國醫藥大學
https://www.facebook.com/19thpsatwac/?ref=br_rs
18th 藥學生年會 於 高雄醫學大學
https://www.facebook.com/PSATW18thKMUP/
http://psatw18thai.wixsite.com/18thpsatwac
17th 藥學生年會 於 嘉南藥理大學&成功大學
https://www.facebook.com/%E7%AC%AC%E5%8D%81%E4%B8%83%E5%B1%86%E4%B8%AD%E8%8F%AF%E6%B0%91%E5%9C%8B%E8%97%A5%E5%AD%B8%E7%94%9F%E5%B9%B4%E6%9C%83-937346093007717/
16th 藥學生年會 於 台灣大學&國防大學
15th 藥學生年會 於 大仁科技大學
14th 藥學生年會 於 台北醫學大學
13th 藥學生年會 於 中國醫藥大學
12th 藥學生年會 於 高雄醫學大學
11th 藥學生年會 於 嘉南藥理科技大學
10th 藥學生年會 於 國防大學
09th 藥學生年會 於 大仁科技大學(因故取消)
08th 藥學生年會 於 台北醫學大學
07th 藥學生年會 於 中國醫藥大學
06th 藥學生年會 於 高雄醫學大學
05th 藥學生年會 於 嘉南藥理科技大學
04th 藥學生年會 於 台灣大學
